眼睛紅、眼屎多能否自愈取決于感染病的原體情況，眼睛紅眼屎多通常代表眼睛出現炎癥，如果僅為病毒引起的炎癥，通常2周左右即可好轉，但部分病毒可能遷延不愈，或病毒感染同時合并細菌感染。此時如果不使用抗生素眼藥水可能較難自愈，嚴重情況時甚至可引起角膜穿孔，若出現眼睛紅、眼屎多的情況，建議及時到眼科就診。可能給予抗生素、抗病毒的眼藥水進行治療，以緩解癥狀，減輕患者的不適感，同時縮短癥狀的存在時間，使局部癥狀盡快好轉，同時也可以預防并發癥出現。部分患者病毒感染1周左右時，可能眼睛紅、眼屎多的癥狀會消失。但病毒可能侵犯角膜，在角膜上形成浸潤斑，后期可能發展為斑翳，甚至永久性存在不能消除。