肺大皰切除術的方式有兩種，常規的開胸手術和胸腔鏡手術，均需在全身麻醉下進行。因為肺大皰切除術是在一側胸腔進行手術，所以做肺大皰切除時要進行支氣管內麻醉，即插入雙腔管，把患者左側和右側支氣管分隔開。手術時讓手術側的肺停止呼吸，讓肺塌陷，方便術者操作，依靠健側肺，即另一側肺進行單側通氣。 在手術過程中患者易出現低氧血癥，這時需進行特殊處理。醫療條件允許時可采用全身麻醉加胸椎旁神經阻滯、全身麻醉加前鋸肌平面阻滯或胸神經阻滯等方式，以達到減少術中全麻藥物用量的目的，且這種麻醉方式下患者蘇醒質量較好，并且可輔助術后鎮痛。