癲癇外科對于手術指征把握，首先是藥物難治性手術，即經過藥物治療效果不好，臨床上比較難控制，患者反復發作。對于上述病人，一般臨床上會用一段時間藥物，原則上會使用3年以上藥物，通過3年以上反復、長時間、多個藥使用無效，病人可以進入臨床癲癇手術評估。 當然部分有病灶患者，比如本身存在血管畸形、顱腦腫瘤，在藥物控制癲癇同時建議盡早進行手術。因為病人本身對藥物敏感性可能比較差，如果不清楚病灶，藥物本身控制效果不是很好。只有通過清楚病灶之后，再結合藥物治療才能達到完全控制癲癇效果。