肛周膿腫術后24小時內，手術創面可能增加因大便摩擦而出現急性出血的風險，因此如果沒有強烈便意，則建議患者24小時后再進行排便。但如果在24小時內，患者有強烈的便意，通常自然排便即可。多數情況不會造成嚴重問題，通常比較安全，不會造成待干預的情況發生。因為肛周膿腫是感染創面，因此大便接觸到創面時，不會出現再次感染的問題。而創面切開后不予以縫合，是為達到引流肛周膿腫膿液的目的。而肛周膿腫創面是否能如期愈合，或肛周膿腫手術后是否復發，多數情況與排便無絕對關系。