無菌性前列腺炎是臨床上治療的重點與難點，目前尚沒有統一規范的治療方案，在治療上多采用以藥物治療在內的綜合性治療和個體治療。藥物治療方面雖然為無菌性前列腺炎，但抗生素的應用仍是治療方法之一。此外，還可采用α受體阻斷劑如坦索羅辛等緩解排尿癥狀，使用地西泮等藥物進行止痛。還可進行精神心理治療以緩解患者的焦慮、抑郁、緊張等。 中醫藥在治療前列腺炎方面獨具優勢，通過采用清熱解毒、利濕通淋、活血化瘀、補腎等不同治法，選擇相應的中成藥或中藥湯劑進行治療，可以取得一定療效。前列腺炎還可采用局部治療的方法，通過前列腺直接注射藥物或直腸內應用栓劑等進行治療。除此之外非藥物療法如前列腺按摩、前列腺熱療、針灸等方法在臨床上也經常使用。除了治療之外，患者更重要的還需要在實際生活中注意避免一切有害于前列腺的因素，保持良好的飲食、生活習慣，避免相關誘發因素。