陰莖背神經切斷術存在的潛在危害，具體如下：1、術后可能會出現早泄或早泄問題改善不明顯；2、患者可能會出現勃起功能障礙，表現為勃起緩慢、勃起后硬度較差，或者勃起以后硬度維持時間較短等，這些均會對患者的性生活質量產生進一步影響；3、有些患者可能會出現局部皮膚壞死等。因此陰莖背神經阻斷切斷術目前在臨床上僅針對頑固的、難治性的早泄，但是在臨床的使用范圍極為有限，僅有極少數醫學中心或泌尿外科的專科進行此操作。其原因在于目前沒有較多的臨床樣本和數據，證實其安全。因此目前醫學上，醫生會非常謹慎的向頑固性早泄患者推薦此治療方案。