小兒腦出血后遺癥根據腦出血的部位及出血量來評估，腦出血位置和出血量決定了患者出現后遺癥的幾率及嚴重性。一般來說，出血量少、癥狀較輕者，通過及時的治療，不會有太大后遺癥；出血量較大、癥狀嚴重且腦實質受壓嚴重者，可能出現后遺癥，常見的有腦積水、腦萎縮、腦軟化、運動和智力障礙、四肢癱瘓、癲癇、肌張力低下等。 腦室周圍包括腦室內出血的近期預后與出血量大小有關。出血量越大，并發腦積水的發生率或病死率越高，出血量大者而且多發生嚴重的智能減退和運動功能障礙等。小腦出血預后較差，出生后不久可能多伴有死亡。新生兒蛛網膜下腔出血主要是靜脈破裂所致，出血量較少，大多預后良好，少數也可因先天性顱內動脈瘤破裂所致，病情危重，預后較差，病死率高達40%。幕上硬膜下出血預后相對較好，而幕下硬膜下出血預后差，病死率較高。