亞急性甲狀腺炎的主要原因是感染，多見于口腔病毒或者上呼吸道病毒，如腮腺病毒、柯薩基病毒、腺病毒、EB病毒，上述病毒是引起腮腺炎、咽炎或者上呼吸道炎癥的常見原因。同時上述病毒也侵犯甲狀腺組織，導致甲狀腺產生炎癥，炎癥較急時會引起喉嚨疼痛、頸部腫脹，炎癥導致儲存在甲狀腺里面的激素大量釋放到血液中，造成甲狀腺激素過多，形成甲亢，引起一系列甲狀腺毒癥，如心慌、出汗、氣急、虛脫等癥狀，部分患者存在發熱癥狀。亞急性甲狀腺炎比急性甲狀腺炎病情輕，不如慢性甲狀腺炎隱匿。甲狀腺就位于咽喉前面，亞急性甲狀腺炎常和慢性咽炎相混合，喉嚨不舒服、頸部不舒服時，會誤認為是咽炎，實際上可能是亞急性甲狀腺炎。如果患者頸部疼痛、咽部疼痛，應及時到醫院就診，患者要提醒醫生是否是甲狀腺出現問題，是否存在急性甲狀腺炎。