激光去痘印的副作用較小，但仍可能會產生疼痛、色素沉著、水腫、水泡、疤痕等癥狀，其中水泡及疤痕較為少見。疼痛癥狀與患者個人體質有關，若患者感覺疼痛較為嚴重，則可涂抹麻醉藥物；若出現色素沉著，無需過度驚慌，隨時間進展可逐漸消退，日常加強防曬護理即可。因此，建議患者進行激光去除痘印的治療時，應盡量選擇正規醫院，由專業醫生進行操作，以減少以上副作用的發生。