面肌痙攣手術后的后遺癥包括同側的聽力障礙、耳鳴、嚴重的有耳聾，還有遲發性的面癱、腦脊液耳漏、頭暈、走路不穩、復視 ，以及后組顱神經癥狀，像吞咽困難、嗆咳等等。出現并發癥后，通過一般的治療大多都能恢復。當然，隨著顯微鏡技術的提高，手術的并發癥越來越少，但還是避免不了。