一旦發現心臟黏液瘤，首選外科手術將其摘除。以前的外科手術都是做傳統的正中開胸手術取出黏液瘤，現在可以通過微創胸腔鏡的方法，在胸腔鏡下將黏液瘤取出。患者做完手術，不必擔心手術的預后，黏液瘤是良性腫瘤，手術摘除以后，大多數患者預后較好。 黏液瘤通常有一個蒂附著在房間隔上，大多數的心臟黏液瘤都在心臟的左心房，少部分是在心臟的右心房。黏液瘤長大以后，在左心房內會隨著血流飄動，甚至脫落，一旦脫落，會造成非常嚴重的后果，引起二尖瓣梗阻或腦梗等體循環的栓塞。