晚上睡覺全身骨頭疼的原因如下：1、骨質疏松脫鈣加快：隨著年齡增長，特別是女性在絕經后雌激素水平下降非常快，導致骨頭脫鈣加快、鈣沉積減慢，特別是夜間，因為沒有食物的攝入、鈣的補充、陽光照射、維生素D的生成，導致骨頭脫鈣進一步加快，部分患者會出現全身骨頭的疼痛、酸疼，最后提示可能存在缺鈣而骨質疏松，這時需要做檢查，通過口服鈣片、活化的維生素D緩解癥狀，嚴重患者可以加用二膦酸鹽，抑制破骨細胞活性的藥物，緩解疼痛；2、其他：比如有些腫瘤患者的骨轉移，也會引起全身骨頭酸痛。甲狀旁腺功能亢進等內分泌疾病，也會導致脫鈣的加快，需要到相應科室做檢查明確診斷，根據病因進一步治療。