早上起來后手指關節疼痛主要分為兩大類原因，具體如下：1、手指關節病變：如果存在類風濕關節炎、年齡大的患者可能有骨性關節炎，在早晨剛起來時，關節會有僵硬、疼痛的感覺。類風濕關節炎通常是雙手關節均產生疼痛，而且是多個手指同時產生疼痛。因為類風濕疾病是自身免疫性疾病，簡單而言是全身性疾病，所以通常累及多個關節、多個手指關節。如果是骨性關節炎，一般是發力較多的手指，比如食指、拇指、中指這些關節的指間關節，因為發力容易勞損、磨損，易形成骨性關節炎；2、腱鞘炎：肌腱是帶動手指活動的關鍵結構，在腱鞘中滑動，隨著年齡增長或者勞累等其他不良因素，會產生勞損性的問題，即無菌性炎癥。有腱鞘炎后，在早晨相對軟組織血供未活動開時，會感覺疼痛、僵硬，活動手指時產生卡頓的現象，可能是腱鞘炎，甚至狹窄性腱鞘炎。