卵巢囊腫的治療方式取決于患者年齡，是否惡性，囊腫的部位、體積、大小、生長速度，是否保留生育功能以及患者的主觀愿望等因素而定。 一般多采用手術治療，排除卵巢非贅生性囊腫，如囊腫大于5cm，需手術治療，包括開腹手術、腔鏡手術，常用術式為卵巢囊腫切除術、卵巢囊腫剝除術。年紀較大者多采取附件切除術，年輕患者或者有生育要求的患者，多采取卵巢囊腫剝除術。