骨髓移植是治療很多惡性腫瘤的唯一選擇，在急性髓性白血病和大多數的急性淋巴細胞白血病，若不做骨髓移植，尤其是急性髓性白血病，治愈率可能不到30%，所以對70%左右的病人而言，骨髓移植是治好疾病的唯一方法。骨髓移植的好處顯而易見，同時骨髓移植是大型治療，其危害也顯而易見。骨髓移植的危害具體如下：1、植入失敗：種進去的干細胞長不活，類似農民種莊稼，莊稼的種子撒在地里后不能生根發芽，此類情況稱為植入失敗。植入失敗對病人而言，顯然是致命性的危害；2、使用化療藥物：超劑量的化療、致死量的化療，對病人心、肝、腎的打擊能導致病人在早期移植的過程中出現死亡；3、排斥反應：異基因可產生相關反應，即別人的造血干細胞種到病人身上后會發生排斥反應，即種進來的干細胞重新建立免疫系統，而新建立的免疫系統能夠識別自己和別人，對自己人不攻擊，對別人就會認為是敵人進而攻擊。因此，免疫系統植入進來后，病人身體的所有器官，都是免疫系統的攻擊對象，此類情況稱為排斥反應，即移植物抗宿主病；4、容易感染：在骨髓移植的過程中需要用很多的抑制劑，加上免疫系統的重建需要2年左右的時間。因此，接下來的問題就是感染，感染也是骨髓移植后很重要的致死原因；5、其他危害：如移植失敗，移植失敗是指病人的腫瘤重新復發。此外，骨髓移植也還有其他一些很嚴重的并發癥，可能也是致死性。但目前若是做自體干細胞移植，因移植相關死亡的可能性大概在5%。若是異基因的干細胞移植，移植相關不算腫瘤復發的情況，移植的技術本身導致的死亡的病例占10%-15%。