部分噬血細胞可以完全治愈且不再復發，主要取決于噬血細胞的原發疾病，不同原發病決定噬血細胞最終的轉歸。基因缺陷的原發噬血細胞患者，異基因造血干細胞移植為首選，移植治療成功可以獲得治愈。罕見類型的原發噬血細胞不通過異基因造血干細胞移植也可達到長期控制，達到很好的治療效果。獲得性噬血細胞綜合征是否治愈主要取于原發病，如淋巴瘤相關噬血細胞綜合征，淋巴瘤得到完全控制，噬血細胞不會再復發。