復方玄駒膠囊對部分多囊卵巢有一定治療作用。多囊卵巢是平時所說的多囊卵巢綜合征，是臨床上一種常見的內分泌代謝性疾病，患者突出的癥狀是高雄激素血癥和慢性不排卵，因此而出現的多毛、痤瘡、閉經和不孕等癥狀。多囊卵巢在中醫學中的證型比較常見的是痰濕型和腎之陰陽失調型，復方玄駒膠囊對于腎之陰陽失調中的腎陽虛衰型有一定的作用，因為復方玄駒膠囊的主要作用是溫補腎陽。但是對于痰濕型和腎陰虛這兩個證型的多囊卵巢，復方玄駒膠囊沒有明確的治療作用。多囊卵巢的治療其實要在月經中分期進行辨證論治，因此更加推薦在專業醫生的指導下分期進行個體化的辨證治療，而不是統一采用某種中成藥。