男性尿道疼痛最常見的病因為尿路感染，同時應觀察有無合并其它癥狀，如尿頻、尿急、尿道有無異常分泌物，其次為是否存在前列腺炎。其它原因相對少見，如膀胱結石，伴尿流中斷、尿道疼痛癥狀。 還應分析伴隨尿痛癥狀的時間點，是排尿初始期、終末期或全程。整個過程都疼痛，考慮尿路感染；在初始期或是終末期疼痛，考慮前列腺炎。治療應根據尿常規等檢查結果進行處理。若為尿路感染可給予抗菌素治療；若為前列腺炎可根據亞型不同進行藥物處理，應用或不用抗菌素。