馬應龍痔瘡膏與馬應龍痔瘡栓的藥物成分相似，效果亦相似，僅為劑型差異，因此其治療的具體病種也有一定差異。馬應龍痔瘡栓主要應用于內痔，而馬應龍痔瘡膏適用于外痔。但目前馬應龍痔瘡膏也有單支長頭類型，可以將長頭塞入肛門，使痔瘡膏能夠擠入到直腸內，即內痔、外痔均可使用此種痔瘡膏治療，對此痔瘡栓可能僅能夠用于內痔治療。從使用方便角度而言，馬應龍痔瘡膏可能更適合、更方便。但具體病種的治療效果而言，馬應龍痔瘡膏和馬應龍痔瘡栓無明顯差異，即其各自針對病種的效果均較為明顯。