男性孕檢檢查應該掛男科，因為與男性生育有關系的是男性生殖系統，生殖系統包括睪丸、附睪、輸精管、前列腺、精囊等，涉及男性功能如男性生育、性功能的問題就屬于男科的管轄范疇。男科是一個是分科較細的專業，大醫院或者三甲醫院可能會有男科。如果沒有男科，也不用過于擔心，男科歸屬于泌尿外科，所以可以咨詢泌尿外科醫生。基層醫院可能沒有泌尿外科，這種情況建議可以咨詢外科，因為外科包括泌尿外科、男科，具體要咨詢當地醫院的分科情況。