甲硝唑氯己定洗劑主要是可以用于陰道感染性疾病，作為洗劑，主要進行陰道的沖洗。該藥物是局部的藥物，一般沒有明顯的副作用。但是在使用時需要注意個別患者可能會發生過敏反應，比如可能會出現用藥部位的紅腫、皮疹、其他的過敏情況、刺激的感覺，這時建議可以暫停使用。另外，該洗劑雖然起到抗菌消毒的作用，但是使用時一定要有用藥的指征，該洗劑不建議患者作為日常的護理液或者是清洗液來使用。因為其中所含有的抗菌的成分，如果在沒有用藥指征情況下，長期使用可能會發生陰部的菌群失調，由此更容易發生陰道的感染性疾病。因此，要在醫生的指導下使用，不能夠長時間的使用。