咽喉發癢、咳嗽可以由多種病因引起，常見原因如下：1、呼吸系統疾病：如咳嗽變異性哮喘，是一種特殊類型哮喘，在夜間多發，與外界因素的刺激相關。在受到刺激后，患者會出現咽癢、咳嗽表現，并且在白天、夜間均可發作。此外，嗜酸性粒細胞性支氣管炎、變異性咳嗽均可導致患者出現咽癢、咳嗽表現。咳嗽呈陣發性發作，可以由于誘發因素所誘發；2、消化系統疾病：如胃食管反流病，患者胃內容物等酸性物質反流到咽部，刺激咽部而發生咽炎、咳嗽等癥狀。常伴有反酸、打嗝、燒心等伴隨癥狀，也可發生無癥狀反流，患者僅有咽癢、咳嗽表現。