顱內囊腫通常由先天性因素導致，屬于胚胎發育過程中組織殘留所形成，通常分為以下幾類：1、包裹腦脊液的囊腫：比如蛛網膜囊腫，常見的發生部位是顳極或者枕大池，主要由于蛛網膜包裹腦脊液形成；2、具有分泌功能的囊腫：如表皮上的囊腫，常常發生在橋小腦角區，這些囊腫是由于囊壁具有內分泌功能，向囊內分泌角化蛋白、脂質等物質，導致囊腫逐漸擴大，進而引起癥狀；3、Rathke囊腫：Rathke囊腫是一種先天性細胞殘留所形成的囊腫，位于垂體部位，在囊腫增大時可引起垂體相關的內分泌癥狀；4、松果體區的囊腫：此部位的囊腫多由先天因素導致，通常在后天的觀察過程中不會出現明顯的增大，也不容易引起癥狀。