孕酮低造成胚胎停育的原因，可能因為孕酮對子宮內膜、子宮肌肉作用消失。前提胚胎本身沒有問題，胎停孕只是因為孕酮低造成，孕酮對子宮內膜作用，主要在雌激素作用上，使子宮內膜變成分泌期變化。主要表現腺體變長，然后彎曲，血管也增長彎曲，間質比較疏松、水腫，此外間質當中存在較多營養物質，子宮內膜較厚，此種情況有利于孕卵著床，和胚胎生長發育需要。對子宮主要抑制子宮收縮，防止子宮排除宮內物作用。如果孕酮低，對子宮內膜作用消失，破壞孕卵、胚胎生長環境，以及對子宮肌肉抑制作用消除后，造成子宮收縮，增加流產。