第三代試管嬰兒需在體外進行操作，通過顯微注射針進行穿刺，對胚胎有一定影響，主要影響如下： 1、體外環境對胚胎造成一定影響； 2、正常胚胎有八個細胞，取出一個細胞，對胚胎發育可造成損傷。若在囊胚期取滋養層細胞，可取3-5個甚至7-8個，對胚胎后期存在一定影響。 第三代試管嬰兒需嚴格控制適應癥，如單基因疾病或染色異常等情況，才可采取第三代技術。