安置心臟起搏器后，短期并發癥主要是圍手術期可能出現的問題，如囊袋內的血腫或感染，一旦出現囊袋感染、破潰，必須要去除整個起搏器，否則易造成感染性心內膜炎；長期并發癥，包括起搏器囊袋感染、起搏器綜合征、起搏器介導心臟功能改變，心臟結構的改變，如右房、右室增大、三尖瓣關閉不全等。臨床上通過不斷嘗試，技術日漸增進，并發癥也在逐步減少。