髓母細胞瘤根據腫瘤的大小、腫瘤的播散情況、手術的切除程度可分為兩類。腫瘤較大、手術未能完全清除、發生轉移的髓母細胞瘤患者，歸類于高危組。其他患者歸類于中危組。對于高危組而言，五年生存率約為50%左右。目前也有報道，自體干細胞移植支持下的大劑量的化療，可將五年生存率從50%提高到70%左右。對于中危組的患兒，五年生存率可達到80%以上。隨著治療方法的多樣化，髓母細胞瘤的生存率有望得到明顯的提高。