肌肉組織活檢比較復雜，隸屬病理室工作范疇。肌肉組織活檢可分為常規電鏡、光鏡以及組織化學相關檢查。從電鏡、光鏡方面講，組織取好之后，先經過固定，然后經過染色，針對不同肌病進行不同染色，之后在光鏡或電鏡下觀察，看其有無特征性形態，或特殊染色顏色，以判斷肌病類型。組織化學檢查更為復雜。目前病理診斷中，肌病越來越多，遺傳及理化因素損害導致肌病的情況也越來越多。