小便刺痛主要是由病原菌感染尿道引起，男性、女性都可發生，病原菌包括細菌、支原體、衣原體，部分性病也會出現小便刺痛，小便刺痛時要多飲水，及時到專科醫院檢查，涉及的科室有皮膚性病科、泌尿外科、抗感染科，尿道有分泌物時可進行分泌物培養、涂片檢查，明確病原體的類別，結合病原體用藥治療，常見的病原體有大腸桿菌、金色葡萄球菌、支原體、衣原體、淋球菌。