肝臟腫瘤均需要借助免疫組化，或者特殊染色進行鑒別診斷，具體如下： 1、如果是肝細胞性肝癌，會選用肝細胞特異性標記物，如AFP、GPC-3、CD34、CK8-18等，這是肝細胞的特異性標記物，通常細胞性肝癌會呈現陽性； 2、如果鑒別轉移性癌，要結合鏡下所見，分別運用不同抗體。如果臨床懷疑是肺來源，會選用肺特異性標記物，比如TTF-1、NapsinA等；如果懷疑是胃腸道來源的，會選用CDX-2、invitrogen等；如果是女性，考慮是乳腺轉移，會選用ER、PR等； 3、檢測病毒肝炎史，如果是檢測有無乙肝病毒，會選用乙肝病毒抗原；如果是巨細胞病毒，會用巨細胞病毒抗原；如果有EB病毒，會檢測EB病毒； 4、鑒別肝臟代謝性疾病，做特殊染色，如鐵染色、Masson染色、網狀纖維染色； 5、預后指標通常做的較多的是Ki-67、P53、Bcl-2。