腦部造影，屬有創性檢查，檢查過程中需注射造影劑，過敏體質患者，或對某些藥物過敏者可能產生過敏反應。另外，造影穿刺過程中可能損傷到血管，造成局部血腫，發生栓塞事件，甚至臟器大出血，但目前此類風險的臨床發生率極低。且臨床也有一系列的預防及預警措施，比如易過敏者可預先進行過敏試驗，既往有出血性疾病，或肝、腎等臟器功能損害者，應在醫生評估后決定是否適宜腦部造影檢查。