女性性腺功能主要指卵巢功能，化療易損傷卵巢功能，進而導致激素水平低下，患者可表現為閉經或陰道干澀。卵泡細胞的損傷程度與藥物劑量有關，部分呈持久性損傷，嚴重者導致不孕。化療前可以通過注射促性腺激素抑制劑對卵巢、卵母細胞進行保護，還可冷凍部分卵泡細胞，以作受孕準備。臨床建議患乳腺癌且有生育要求的患者，可先進行卵巢功能保護治療再接受化療，效果較好。