三叉神經開顱微血管減壓術應用內鏡的情況下，平均整體治療費用是3萬元左右。手術過程相對較短，全程大約一小時左右，因此手術費用控制相對嚴格。以濟南市為例，醫保報銷60%-70%，自付比例大概在1萬元左右。具體費用存在個體差異，單純三叉神經痛未出現合并癥者花費相對較低；合并糖尿病、高血壓或心臟病的患者，術前需要嚴格監測、會診、檢查、治療，手術費用相對較高，甚至超過4萬元。