通常房間隔缺損5mm以上需進行手術，此外手術也與房間隔缺損位置、小兒年齡相關。房間隔缺損手術小兒需3歲以上、10kg以上方可進行。房間隔缺損大小為5mm-36mm之間可進行介入手術，但房間隔缺損較大或房間隔缺損部分較簡單，則不建議進行介入手術。較小房間隔缺損對人體無較大影響也不建議手術，因手術材料中封堵器為雙面傘狀，房間隔缺損周圍需有相對放置封堵器的位置。