左氧氟沙星最常見的不良反應為胃腸道反應，如腹部不適、疼痛、腹瀉、惡心、嘔吐等，以及頭暈、頭痛、嗜睡、失眠。偶見過敏反應，在陽光照射一定時間后發生皮膚過敏，服藥后盡量避免暴露在陽光下。 本品可引起癲癇發作、精神異常、煩躁不安等癥狀，癲癇病史者避免使用。服用本品后多飲水，可避免出現尿結晶。喹諾酮類藥物過敏、孕婦嬰幼兒、18歲以下青少年應禁用，哺乳期婦女用藥時暫停哺乳。