尿路結石形成較為復雜，目前病因尚不明確，常與結石成分關系較大。如最常見的草酸鈣結石，形成機制常與飲食、遺傳因素、地理環境、生活習慣等密切相關；如尿酸結石常與患者尿酸代謝異常有關，臨床數據表明25%的痛風患者會出現人體結石；感染性結石需患者嚴格控制感染；胱氨酸結石常由遺傳導致，需外科治療協同終生服用藥物治療，否則結石容易復發。