單純性腎囊腫不屬于嚴重疾病。如果臨床上腎囊腫超過5cm，可選用外科治療，包括穿刺治療及腹腔鏡手術切除治療。但穿刺治療術后腎囊腫復發率較高，臨床需注入硬化劑，過去常用的硬化劑為無水酒精，部分患者對酒精過敏或酒精出現外溢，可引起難以處理的并發癥或者合并癥。若腎囊腫合并出血、感染、鈣化、結石等，常提示囊腫并非單純性腎囊腫，患者應進一步檢查以明確診斷。