治療肺結核一般口服一線抗結核藥物，初治患者常用四種一線結核藥物，包括異煙肼、利福平、吡嗪酰胺及乙胺丁醇，其復方制劑，稱為FDC。二線藥物主要用于對一線藥不耐受或有耐藥性的患者，以及復治與重癥患者。常用二線藥物包括喹諾酮類的藥物如左氧氟沙星和莫西沙星；注射藥物包括鏈霉素、卷曲霉素、阿米卡星等。耐多藥患者根據病情需進行注射治療6-8個月，甚至12個月。