穿透性角膜移植手術即在手術過程中將患者的角膜全部去掉，換成健康角膜，適用于重癥全角膜層渾濁或角膜全層變薄等疾病，術后可有一定排斥反應，需在較長時間內應用抗排斥藥物，以保障角膜的安全。此手術的術后效果較好，可一定程度恢復患者視力，滿足正常生活需要。此外，臨床中亦有板層角膜移植手術，可改善各種原因引起的角膜疾病，如角膜變薄、角膜即將破裂等。