喉囊腫較小且無呼吸困難、出氣不勻、喉嚨疼痛或咽部異物感等臨床癥狀時不易發現，出現呼吸困難、吞咽困難需手術治療。喉囊腫有多種類型，如喉內型表現為咽部異物感，嚴重的呼吸困難需手術治療，可通過間接喉鏡、直達喉鏡、顯微鏡下進行囊腫切除；喉外型需嚴格區分鰓裂囊腫與甲狀舌管囊腫，通過頸外入路進行手術切除；混合型需從喉內、喉外同時進行手術。喉囊腫一旦出現癥狀必須及時就診否則可能出現不良反應甚至生命危險。