頭部CT在急診是首選檢查，對頭部顱腦的炎性病變、腫瘤、先天性畸形、血管性病變均可診斷，在動脈瘤、動脈血管畸形、急性腦出血和蛛網膜下腔出血方面也有優勢。顱腦磁共振可多方位和三維成像，使病變定位和診斷更準確。 還可觀察病變與鄰近血管的關系，對腦干、幕下區、枕骨大孔顯示優于CT，對腦腫瘤、腦部炎性病變、腦白質病變、腦梗塞、血腫、腦部先天性異常等診斷較CT敏感。 同時磁共振無需造影劑就可顯示腦部血管，發現動脈瘤和動脈畸形，因此磁共振在顱腦檢查方面優于CT。