腫瘤標志物檢測費用不能一概而論，醫院不同，收費方式也不同，如部分醫院采取組合收費，也有部分醫院采用單項收費。一般全面的腫瘤標志物檢測費用約一千多元，若為針對性單項檢測，如癌胚抗原或甲胎蛋白，則會采取單項收費，費用約為數十元或數百元不等。腫瘤標志物檢測在作為普通體察時，醫保不予報銷，但已經確診腫瘤的患者做腫瘤標志物檢測時可使用醫保進行報銷。