新生兒便秘與喂養方式、奶量、喂養方法有關，通常母乳喂養者大便一天數次，人工喂養者大便數天一次。出現新生兒便秘建議首先沿著順時針的方向輕輕按摩腹部，同時在臍部熱敷，適當服用益生菌之類的調節腸道環境的藥物，如媽咪愛、培菲康、整腸生等。超過三天以上仍無大便者，建議口服導瀉藥物，如甘油、乳果糖，或肛門局部使用甘油促進大便排出，但不可長期使用，以免產生依賴性。