治療心肌肥厚較好的藥，目前主要是β受體阻斷劑，主要的藥物有倍他樂克，也就是美托洛爾，還有比索洛爾等藥物。β受體阻滯劑能有效控制心率，降低心肌的氧耗來改善癥狀。有的心肌肥厚可能有畸形性結構性心臟疾病存在，此種情況要配合藥物治療，然后進行心臟畸形的矯治，這樣也可以改善癥狀，控制心率。主要是用β受體阻滯劑，如美托洛爾和比索洛爾。同時還可以控制心肌肥厚后造成的心律失常，控制或降低心肌的氧耗，這樣可以達到改善心臟的功能，延長生命的目的。