目前隨著微創手術發展，骨樣骨瘤也可以進行微創手術治療，比如經皮冷凍、激光，對瘤巢進行破壞，將腫瘤原發中心切除，可達到痊愈治療目的。所以骨樣骨瘤可以進行傳統的手術切除、植骨，也可考慮微創手術，即經皮CT引導精準定位下瘤巢組織切除手術。 骨樣骨瘤手術治療，早期進行切開、瘤巢破壞和腫瘤完整切除。如果位于肢體承重部位，對肢體原有骨結構有一定破壞，對腫瘤進行切除以后可以相應植骨，重建骨骼承重力。