通常捐獻骨髓對身體的危害較微弱，可以忽略不計。前期在做造血干細胞移植時，主要是通過骨髓捐助，一般獻骨髓量也較多，在操作之前都要給病人預留自己的血液，預留血液的量和采集骨髓量相同，但危害并不是很大。目前醫療水平下，采集骨髓的量已經越來越少，同時會聯合采集病人的外周血干細胞。目前造血干細胞移植都是采集部分骨髓，再加上供者的外周血干細胞輸注，采集骨髓的量就更少。因此對于供者，通常沒有明顯危害。采集一般在手術室的局部腰麻下完成，對于供者，捐獻骨髓在目前的診治水平中危害較小。