痰液檢查主要通過痰液內的細胞學變化，明確診斷。細胞學檢測主要根據氣道的脫落上皮細胞成分，如腫瘤性成分累及氣道后或非腫瘤性病變在氣道內通過分泌物排出后制片，可觀察到其中細胞成分。此時可根據成分判定病變性質，特別為腫瘤性病變、非腫瘤性病變及感染性病變等。 痰液培養主要通過培養基觀察致病菌生長，致病微生物通過培養基滋養可密集生長，形成類似于菌落樣團塊。檢驗科可通過病變分析判定致病菌為何種類型，同時判定致病菌是否屬感染性病變及其感染類型。