系統性紅斑狼瘡患者預期壽命存在個體差異，不同患者發病過程、臨床表現不完全一致。若病情穩定、積極科學治療基礎上，多數患者5年存活率可以達到90%以上，10年存活率在85%以上。但若未發病初期即出現嚴重臟器受累，如腎功能不全、神經脊髓病變等危險因素者，愈后相對較差，甚至過早出現死亡。目前多數系統性紅斑狼瘡患者均可控制良好，帶病生存。