膠囊胃鏡實際為自動拍照的微型相機，每秒拍2-8張照片，目前膠囊胃鏡均為變頻相機，即膠囊于腸道中運動越快，其拍照速度越快，脫運動較慢，則拍照較慢。但腸道未準備好時，膠囊胃鏡既不可吸引亦不可沖洗。膠囊長1cm，直徑3-4mm，其視野受到一定限制，僅適合小腸檢查，不適合胃及結腸檢查，且發現病變亦無法進行活檢。膠囊胃鏡屬單純篩查性檢查，若懷疑小腸病變，可首先進行該項檢查，發現病變再行進一步活檢治療，但小腸病變較隱蔽，存在漏診幾率。