臨床多數慢性鼻竇炎患者并發癥主要表現眶內并發癥與顱內并發癥，其中，眶內并發癥可見鼓膜下膿腫、球內感染，顱內并發癥包括腦膜炎、腦膿腫等，此類并發癥發病較劇烈、較突然，如侵襲性、真菌性鼻竇炎，發病較急，甚至短時間內發生昏迷、意識障礙，患者眶內、顱內同時出現并發癥，需提起高度重視。而急性鼻竇炎患者中抵抗力偏弱者，可出現全身癥狀，如發燒、白細胞增高，甚至出現敗血癥、菌血癥問題。